Quoi de neuf
Le court article de Jeremie Zumer: Pepid: a Highly Modifiable, ML-Friendly Peptide-Centric Search Engine, introduisant le moteur de recherche du labo Lemieux, sera presentée lors de la conference Apprentissage Automatique et Biologie Computationelle (Machine Learning and Computational Biology, MLCB) 2022. L’affiche peut être téléchargée en suivant ce lien (1.3MB).
Léonard Sauvé presente sa méthode de visualisation de données transcriptomiques dans les leucémies LAM par Factorized Embedding durant le RéseauxLAB 2022. Le modèle de Factorized Embeddings à été developé par Assya Trofimov durant son doctorat dans le labo Lemieux. L’affiche est maintenant accessible publiquement en suivant ce lien (2.0MB).
La presentation de Caroline Labelle, intitulée en anglais: Bayesian Inference as a Robust Alternative to Non-Linear Regression for Dose-Response Parameters Assessment, à été acceptée à l’édition 2022 de la Conférence Internationale sur les Systèmes Intelligents pour la Biologie Moléculaire (ISMB). Le résumé de la présentation peut être retrouvée en ligne (en anglais seulement).
Une nouvelle analyse bioinformatique des séquences de RCT humains d'Assya Trofimov révèle deux classes principales de RCT fonctionnellements distincts. Son papier, une collaboration avec des chercheurs du laboratoire de Claude Perreault, est accessible sur le serveur de pre-impression BioRXiv en suivant ce lien.
Une nouvelle affiche présentant les travaux de Léonard Sauvé a été acceptée pour présentation à la 26e conférence internationale sur la recherche en biologie moléculaire computationelle, alias RECOMB 2022. La présentation en anglais, intitulé “Impact of Dimensionality REduction Parameters for Cox Proportional-Hazards Applied to Cancer Gene Expression”, sera publiquement accessible à une date ultérieure. La note d’acceptation de l’affiche peut être visualisée en suivant le lien vers le site de RECOMB 2022, sous la rubrique “Program”, puis “Accepted Posters”. La conférence RECOMB 2022 se déroule du 22 mai au 25 mai à La Jolla, Californie, États-Unis. L’affiche est maintenant accessible publiquement en suivant ce lien (318KB).
Félicitations à Assya Trofimov, qui a remportée la prestigieuse bourse post-doctorale Mahan. Ce concours est tenu annuelement par la Fred Hutchison Cancer Research Center de Seattle pour récompenser les candidatures exceptionnelles par un support financier pour un projet de recherche en biologie computationelle de 21 mois.
